Références et contributions

Projets de développement

T3, traitement des thons tropicaux (package R). La nature multi-espèces des pêcheries de surface de thon tropical donne lieu à une série de difficultés lors de l'estimation des statistiques de capture par espèce et de capture par taille. Le Traitement des Thons Tropicaux a été construit il y a environ 30 ans afin de corriger les biais des données des journaux de bord sur la composition des espèces et de fournir des estimations plus précises des captures par espèce pour la flotte de senneurs.

Furdeb, fonction pour le developpement sous R et au delà ! (package R). L'objectif de ce package est de fournir un ensemble de fonctions est processus standardisés sur de multiples domaines comme la manipulation de base de données, la géostatistique ou encore la manipulation de données au sens large.

Acdc, aide à la production et la standardisation des appels de données (package R). Ce paquet R fournit des processus pour soutenir les productions d'appels de données. Ces processus passent par les extractions et les liens à partir des bases de données Ob7 (Observatoire des écosystèmes pélagiques tropicaux exploités), les contrôles de qualité, l'analyse descriptive et la conception des données.

Codama, processus communs pour le contrôle de la qualité des données (package R). Ce paquet a pour but de fournir une série de processus de contrôle standardisés et génériques pour l'évaluation et le suivi de la qualité des données.

Fishi, indicateurs pour les pêcheries (package R). Ce paquet a pour objectif de fournir des processus standardisés exploratoires et descriptifs des données associées à la pêche.

Projets et contribution européens

Implication dans les groupe de coordination régionaux. Ces groupes sont le principal centre de coordination et de coopération régionales au sein des différentes régions qui contribuent au cadre de collecte des données sur la pêche. Ils s'efforcent également de coordonner leurs actions avec les pays tiers ayant une souveraineté ou une juridiction sur les eaux de la même région marine. Conformément au règlement (CE) 2017/1004, ces groupes doivent viser à élaborer et à mettre en œuvre des procédures, des méthodes, une assurance et un contrôle de la qualité pour la collecte et le traitement des données, afin de permettre d'améliorer encore la fiabilité des avis scientifiques. Ils sont composés d'experts nommés par les États membres, y compris les correspondants nationaux des etats membres pour la collecte des données, et la Commission.
Présidence du groupe de coordination régionale des grands pélagiques de 2020 à 2021 et actuellement président du sous-groupe intersessionnels portant sur le développement d'une base de données régionales pour les grands pélagiques.

FISHN'CO (MARE/2020/08) : Renforcer la collecte de données EU-MAP en développant des plans de travail régionaux pour les groupes de coordination régionaux Atlantique Nord, mer du Nord et Arctique oriental, Baltique, grands pélagiques et celui sur les aspects économiques.
Référent pour les grands pélagiques et co-coordinateur d’un WP.

SECWEB (MARE/2020/08) : Développer des mécanismes pour soutenir la planification et l'exécution des tâches administratives ainsi que l'image de marque et la visibilité en ligne des groupes de coordination régionaux dans le but d'établir une structure de soutien à long terme.
Référent pour les grands pélagiques.

RECOLAPE (MARE/2016/22) : Renforcement de la coopération régionale dans le domaine de la collecte de données sur la pêche pélagique.
Co-coordinateur du WP2 et coordinateur du WP5. Rapport final disponible ici.

Encadrements et enseignements

Aragno, V., 2019. Estimation des biais de déclaration des thonidés dans les livres de bord pour la pêche à la senne en milieu pélagique tropical. Rapport de stage. 38 pages.

Depetris, M., Floc'h, L., Duparc, A., 2021. L'observatoire des écosystèmes pélagiques tropicaux exploités, un système d'information complexe de collecte, de bancarisation, d'analyse et d'utilisations variées de données hétérogènes (pêches, obeservateurs embarqués, VMS, enquêtes). Presentation pour le module Approche Ecosystémique des Ressources Marines Exploitées (AERME).

Depetris, M., 2021. Formation R developpement de package. Formation dans la cadre du réseau Montpellier Bio-Stat (MBS) et la KIM DATA & LIFE SCIENCES.

Publications avec comité de lecture

Zubia, M., Depetris, M., Flores, O., Turquet, J., Cuet, P., 2018. Macroalgae as a tool for assessing the ecological status of coral reefs under the Water Framework Directive: A case study on the reef flats of La Réunion (Indian Ocean). Marine Pollution Bulletin 137, 339–351.https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2018.10.029.

Publications sans comité de lecture ou vulgarisations

2022

Guillou, A.M., Bodin, N., Chassot, E., Duparc, A., Fily, T., Sabarros. P.S., Depetris, M., Amandè, M.J., Lucas, J., Augustin, E., Diaha, N.C., Floch, L., Barde, J., Pascual-Alayón, P.J., Báez, J.C., Cauquil, P., Briand, K., Lebranchu, J. (2022) Tunabio: biological traits of tropical tuna and bycatch species caught by purse seine fisheries in the Western Indian and Eastern Central Atlantic Oceans. Biodiversity Data Journal 10: e85938. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e85938

2020

Duparc, A., Depetris, M., Cauquil, P., & Lebranchu, J., 2020. Improved version of the Tropical Tuna Treatment process: New perspectives for catch estimates of tropical purse seine fishery. Report of the 22nd Session of the IOTC Working Party on Tropical Tunas - Stock Assessment Meeting, 1–21.

Duparc, A., Depetris, M., Floch, L., Cauquil, P., Bach, P., & Lebranchu, J., 2020. Development status of the new Tropical Tunas Treatment (T3) software. Report of the 22nd Session of the IOTC Working Party on Tropical Tunas - Data Preparatory Meeting, 1–5. IOTC-2020-WPTT22(DP)-INF01.

Duparc, A., Floch, L., Cauquil, P., Depetris, M., Lebranchu, J., Yala, D., Bach, P., 2020. Statistics of the French purse seine fishing fleet targeting tropical tunas in the atlantic ocean (1991-2019). Col Vol Sci Pap ICCAT, SCRS/2020/137 77, 73–102.

2019

Duparc, A., Aragno, V., Depetris, M., Floch, L., Cauquil, P., Lebranchu, J., Gaertner, D., Marsac, F., & Bach, P., 2019. Assessment of the species composition of major tropical tunas in purse seine catches: A new modelling approach for the Tropical Tuna Treatment processing. Case of the French fleet in Atlantic Ocean. Col.Vol.Sci.Pap. ICCAT, 76(6), 951–982. SCRS/2019/189.

Duparc, A., Aragno, V., Depetris, M., Floch, L., Cauquil, P., Lebranchu, J., Gaertner, D., Marsac, F., & Bach, P., 2019. Assessment of the species composition of major tropical tunas in purse seine catches: A new modelling approach for the Tropical Tuna Treatment processing. Case of the French fleet in Indian Ocean. Report of the 21th Session of the IOTC Working Party on Tropical Tunas, 1–35. IOTC-2019-WPTT21-10.

Floch, L., Depetris, M., Dewals, P., Duparc, A., Kaplan, D.M., Lebranchu, J., Marsac, F., Pernak, M., Bach, P., 2019. Statistics of the French Purse Seine Fishing Fleet Targeting Tropical Tunas in the Indian Ocean (1981-2018) (No. IOTC-2019-WPTT21-11_Rev1). Indian Ocean Tuna Commission Working Party on Tropical Tunas (WPTT).

2018

Bach, P., Cauquil, P., Depetris, M., Duparc, A., Floch, L., Lebranchu, J., Sabarros, P., 2018. Procédures d’échantillonnage au port des thonidés tropicaux dans les océans atlantique et indien.

Duparc, A., Cauquil, P., Depetris, M., Dewals, P., Floch, L., Gaertner, D., Herve, A., Lebranchu, J., Marsac, F., Bach, P., 2018. Assessment of accuracy in processing purse seine tropical tuna catches with the T3 methodology using French fleet data. Presented at the 20th working party on tropical tunas, IOTC, Mahé, Seychelles.

Floch, L., Dewals, P., Bach, P., Medieu, A., Depetris, M., Duparc, A., Lebranchu, J., 2018. Statistics of the French purse seine fishing fleet targeting tropical tunas in the Indian Ocean (1981-2017). Presented at the 14th Working Party on Data Collection and Statistics, IOTC, Mahé, Seychelles.

Floch, L., Herve, A., Irie, D., Guillou, A., Depetris, M., Duparc, A., Lebranchu, J., Bach, P., 2018. Statistics of the French purse seine fishing fleet targeting tropical tunas in the Atlantic Ocean (1991-2017). Presented at the SCRS Species Groups meetings, ICCAT, Madrid, Spain.

Katara, I., Gaertner, D., Marsac, F., Grande, M., Kaplan, D., Guéry, L., Depetris, M., Duparc, A., Floch, L., Lopez, J., Abascal, F., 2018. Standardisation of yellowfin tuna CPUE for the EU purse seine fleet operating in the Indian Ocean. Presented at the 20th working party on tropical tunas, IOTC, Mahé, Seychelles.